（三）进项税金控制额
本期进项税金控制额=（期末存货较期初增加额+本期销售成本+期末应付账款较期初减少额）×主要外购货物的增值税税率+本期运费支出数×7%.
将增值税纳税申报表计算的本期进项税额，与纳税人财务会计报表计算的本期进项税额进行比较；与该纳税人历史同期的进项税额控制额进行纵向比较；与同行业、同等规模的纳税人本期进项税额控制额进行横向比较；与税收管理员掌握的本期进项税额实际情况进行比较，查找问题，对评估对象的申报真实性进行评估。
具体分析时，先计算本期进项税金控制额，以进项税金控制额与增值税申报表中的本期进项税额核对，若前者明显小于后者，则可能存在虚抵进项税额和未付款的购进货物提前申报抵扣进项税额的问题。
（四）投入产出评估分析指标
投入产出评估分析指标=当期原材料（燃料、动力等）投入量÷单位产品原材料（燃料、动力等）使用量。
单位产品原材料（燃料、动力等）使用量是指同地区、同行业单位产品原材料（燃料、动力等）使用量的平均值。对投入产出指标进行分析，测算出企业实际产量。根据测算的实际产量与实际库存进行对比，确定实际销量，从而进一步推算出企业销售收入，如测算的销售收入大于其申报的销售收入，则企业可能有隐瞒销售收入的问题。通过其他相关纳税评估指标与评估方法，并与税收管理员根据掌握税负变化的实际情况进行比较，对评估对象的申报真实性进行评估。
二、内资企业所得税评估分析指标及使用方法
（一）分析指标
1.所得税税收负担率（简称税负率）
所得税税负率=应纳所得税额÷利润总额×100%.
与当地同行业同期和本企业基期所得税负担率相比，低于标准值可能存在不计或少计销售（营业）收入、多列成本费用、扩大税前扣除范围等问题，运用其它相关指标深入评估分析。
2.主营业务利润税收负担率（简称利润税负率）
利润税负率=（本期应纳税额÷本期主营业务利润）×100%.
上述指标设定预警值并与预警值对照，与当地同行业同期和本企业基期所得税负担率相比，如果低于预定值，企业可能存在销售未计收入、多列成本费用、扩大税前扣除范围等问题，应作进一步分析。
3.应纳税所得额变动率
应纳税所得额变动率=（评估期累计应纳税所得额-基期累计应纳税所得额）÷基期累计应纳税所得额×100%.
