重组日的确定。《办法》对各类重组的时间做了统一规定，总的原则是依据重组合同或协议生效、且权属发生变更的时点确定重组日。对于不同类型的重组，如果需要履行其他法律程序，应结合履行法律程序确定为生效日。如债务重组，以债务重组合同或协议规定的重组业务生效日为重组日；股权收购，以转让协议生效且完成股权变更手续日为重组日；企业合并，以合并企业取得被合并企业资产所有权并完成工商登记变更日期为重组日。
《办法》第十九条对“企业重组后的连续12个月内”定义为自重组日起计算的连续12个月内，明确了以重组日为起算点，同时“连续12个月内”也体现了特殊性税务处理对经营连续性的要求。重组业务完成年度的确定。《通知》第十一条规定，特殊性税务处理的当事各方应在该重组业务完成当年企业所得税年度申报时，向主管税务机关提交书面备案材料。因此，《办法》对重组业务完成年度做出了规定，即可以按各当事方适用的会计准则确定，具体参照各当事方经审计的年度财务报告。由于当事方适用的会计准则不同导致重组业务完成年度的判定有差异时，各当事方应协商一致，确定同一个纳税年度作为重组业务完成年度。
三、企业重组一般性税务处理
《办法》第二章就企业重组适用一般性税务规定的税收管理问题作出了规定，内容包括：企业发生各类重组业务后应附送的资料、企业合并分立如何按照《企业所得税法》及《通知》规定处理税收优惠政策承继问题等。
（一）具体管理规程
《办法》规定，企业发生《通知》第四条规定的适用一般性税务处理的重组，应根据不同的重组类型提供相关的资料。
1、法律形式的改变。由法人转变为个人独资企业、合伙企业等非法人组织，或将登记注册地转移至中华人民共和国境外（包括港澳台地区）的重组，在税务处理上视同原企业注销，进行税务清算。企业发生上述重组，纳税人发生实质性变化，有的从企业所得税纳税人转变为个人所得税纳税人；有的从居民企业转为非居民企业。所以，对原企业应进行税务清算。清算时，由于企业各项资产可能没有真正意义上的销售或转让，为此，应该提供具有合法资质的我国资产评估机构出具的评估证明。
2、债务重组、股权转让，资产转让，关键是交易价格确定问题，因此，无论是否属于关联企业交易，均应提供交易价格的合法证据。其中涉及跨境的，也应该提供公允价格的合法证据。
3、企业合并。适用一般性税务处理的企业合并，如果是存续合并，实际上是一方增资扩股，一方注销。注销方要按企业清算处理，增资扩股方投入资产可以按照评估价格入账。所以《办法》要求企业合并注销方，税务上要进行清算。如果是新设合并，被合并企业均视为注销，税务上都要进行清算。在清算时，《办法》要求对各项资产和负债需提供评估机构出具的资产评估报告。对合并中的存续企业，可以仅对合并（投资）的资产，按照公允价格入账，原有的资产，不做税务处理。
