2.对单位和个人在本通知实施之前开始缴付年金缴费，个人在本《通知》实施之后领取年金的，允许其从领取的年金中减除在本通知实施之前缴付的年金单位缴费和个人缴费且已经缴纳个人所得税的部分，就其余额按照本通知第三条第1项的规定征税。在个人分期领取年金的情况下，可按本通知实施之前缴付的年金缴费金额占全部缴费金额的百分比减计当期的应纳税所得额，减计后的余额，按照本通知第三条第1项的规定，计算缴纳个人所得税。其计算公式为：应纳税额=(每月领取额-已经缴纳个税的缴费部分)×适用税率-速算扣除数。
3.对个人因出境定居而一次性领取的年金个人账户资金，或个人死亡后，其指定的受益人或法定继承人一次性领取的年金个人账户余额，允许领取人将一次性领取的年金个人账户资金或余额按12个月分摊到各月，就其每月分摊额，按照规定计算缴纳个人所得税。对个人除上述特殊原因外，一次性领取年金个人账户资金或余额的，则不允许采取分摊的方法，而是就其一次性领取的总额，单独作为一个月的工资薪金所得，计算缴纳个人所得税。其计算公式为：应纳税额=一次性领取的总额×适用税率-速算扣除数。
补充养老保险允许在企业所得税税前扣除
本次“通知”未涉及补充养老保险，补充养老保险仍按现有法规执行。依据《企业所得税法实施条例》第三十五条规定，企业为投资者或者职工支付的补充养老保险费、补充医疗保险费，在国务院财政、税务主管部门规定的范围和标准内，准予扣除。
根据《补充养老保险费补充医疗保险费有关企业所得税政策问题》(财税[2009]27号)的规定，企业根据国家有关政策规定，为在本企业任职或者受雇的全体员工支付的补充养老保险费，分别在不超过职工工资总额5%标准内的部分，在计算应纳税所得额时准予扣除;超过的部分，不予扣除。
个人领取年金时应纳税款由受托人代扣代缴
通常情况下，个人取得所得由支付所得单位负责代扣代缴个人所得税。也就是说，哪个单位支付了所得，就由哪个单位负责扣缴税款。
个人领取年金时，其应纳税款由受托人代表委托人委托托管人代扣代缴。年金账户管理人应及时向托管人提供个人年金缴费及对应的个人所得税纳税明细。托管人根据受托人指令及账户管理人提供的资料，按照规定计算扣缴个人当期领取年金待遇的应纳税款，并向托管人所在地主管税务机关申报解缴。
就年金所得来看，企业年金、职业年金涉及纳税义务主要集中在缴费和领取两个环节。在年金缴费环节，由个人所在单位在其缴费时，对超出免税标准的部分随同当月工资、薪金所得一并计算代扣个人所得税，并向其所在单位主管税务机关申报缴纳;在年金领取环节，由托管人在为个人支付年金待遇时，根据个人当月取得的年金所得、往期缴费及纳税情况计算扣缴个人所得税，并向托管人主管税务机关申报缴纳。
