许多税务机构都会跟企业签订税收协议，但卢森堡早先就因让步程度超过多数国家而饱受批评。在卢森堡，企业税率为29%，并不算低，但企业实际支付的税率可能极低。
卢森堡政府虽然此前表示出与欧盟的合作态度，但是政府迄今仍拒绝提供一些相关文件，其理由是欧盟委员会对提供这些文件的要求是非法的。卢森堡已经就此进行了上诉。该国政府表示，采取复杂的程序能保护该国的相关立场，并称卢森堡并未对企业实施非法的国家补助。
爱尔兰政府则表示：“如果该委员会确定这些公司获得了非法的优厚待遇，并要求各国政府收回提供的福利，我们保留上诉到欧洲法院的权利。”
对于欧盟发起的调查，苹果公司辩称，它已支付所有应付的税款，并没有侵犯任何法律。此外，该公司表示税法也迫使其在海外持有的绝大多数资产为现金形式，否则需支付高昂的遣返税才能把这些钱转移回美国。苹果还否认从爱尔兰官员处得到了选择性优待，并表示从2007年起该公司在爱尔兰的税负增加了10倍。该公司在一份声明中称，苹果足额上缴了在欧洲的税款。
菲亚特集团拒绝就欧盟的税务调查发表任何评论。星巴克和荷兰政府也持同样的态度。
不过，欧盟并不愿轻易让步。欧委会表示，一旦收到三国以及三家公司的辩护说明，将进行仔细评判以便作出决定。
阿尔穆尼亚还表示，对于三家企业的调查仅仅是打击行动的第一步，追查那些“打擦边球”避税的公司的力度将进一步加大。欧盟对此的调查范围可能会扩大到其它国家和企业。
阿尔穆尼亚说，欧盟委员会已经要求其他两个欧盟国家提供相关信息：分别是英国(包括直布罗陀)和比利时，为此欧盟还可能开启新的调查。
此外，欧盟还将对九个欧洲国家进行所谓“专利盒子”安排的调查。
这种计划由英国政府在2013年4月开始实施。根据“专利盒子”安排，如果某一企业拥有英国知识产权局、欧洲专利局或其他国家的相关司局授予的专利，或者独家授权上述部门授予的专利，那么该企业便可根据“专利盒子”计划申请较低的企业税率。如果某一企业获得了使用他人技术的许可，该企业或许也能从“专利盒子”计划中受益。当某一企业使用某个受专利保护的生产程序，或者提供某项使用专利手段的服务时，该计划也同样适用。
英国打算在2013至2017年逐步引入这一计划。计划设想，在2013财年，将覆盖60%有关的知识产权收益，到2017年4月该计划完全实施的时候，企业知识产权收益的税率将降低至10%。这对技术行业的企业而言无疑是个好消息，很多部门也将从中受益。
