纳税人丢失已开具的普通发票，大多是由保管不善造成。未经过税务机关审核同意，发票取得方用开具方提供的复印件、证明等资料不能作为税前扣除凭据。
(1)纳税人丢失已开具的普通发票的发票联，应根据《发票管理办法实施细则》第三十一条规定，使用发票的单位和个人丢失发票，应于发票丢失当日或次日(节假日顺延)书面报告主管税务机关，并向主管税务机关指定的报刊等媒介刊登公告声明作废。纳税人丢失发票办理丢失声明的，必须在具有全国报刊号的报纸上刊登。
(2)开具发票一方丢失已填开的发票联，应重新开具发票交对方入账。重新开具发票时，应在备注栏填写丢失发票的客户名称、发票种类代码和号码、金额，开票单位。开具发票方记账时附上丢失发票的其他联次作为合法入账凭证。
(3)取得发票一方丢失已填开的发票联，应取得原签发单位盖有公章的证明，并注明原来发票号码、金额和内容等，由经办单位负责人批准后，才能代作原始凭证。实行电子发票的，由开票方按丢失发票代码、号码查询打印(复印)发票图片，加盖开票方公章作为入账凭证。发票存根联或记账联的复印件只能作为原始凭证的附件，不能直接代作原始凭证。发票复印件经提供原件的单位注明“此件是我单位提供，与原件相符”，加盖公章后，方可作为原始凭证。
(4)纳税人将在税务局**的发票联或记账联丢失，可向开具发票的税务机关申请出具曾于X年X月X日开具XX发票，说明取得发票单位名称、购货或服务的单位数量、单价、规格、大小写金额、发票字轨、发票编码、发票号码等的书面证明，或要求开具发票的税务机关提供所丢失发票的存根联复印件，经主管税务机关审核后，可作为合法凭证入账。
(5)纳税人丢失存根联或记账联的，应取得发票联复印件，发票复印件经提供原件的单位注明“此件是我单位提供，与原件相符”，加盖公章后，方可作为原始凭证。
(6)纳税人丢失普通发票全部联次的，按丢失空白普通发票处理。税务机关对丢失普通发票的纳税人，可以按《发票管理办法》第三十六条“违反发票管理法规的行为包括：(五)未按照规定保管发票的”情形，由税务机关责令限期改正，可以并处1万元以下的罚款。
