纳税人需要注意的是，《企业所得税法实施条例》第七十一条第三款规定，投资资产按照以下方法确定成本：（一）通过支付现金方式取得的投资资产，以购买价款为成本；（二）通过支付现金以外的方式取得的投资资产，以该资产的公允价值和支付的相关税费为成本。
股权处置佣金可按比例在所得税前扣除
《关于企业手续费及佣金支出税前扣除政策的通知》（财税[2009]29号）规定，企业发生与生产经营有关的手续费及佣金支出，不超过以下规定计算限额以内的部分，准予扣除；超过部分，不得扣除。保险企业：财产保险企业按当年全部保费收入扣除退保金等后余额的15%（含本数，下同）计算限额；人身保险企业按当年全部保费收入扣除退保金等后余额的10%计算限额。其他企业：按与具有合法经营资格中介服务机构或个人（不含交易双方及其雇员、代理人和代表人等）所签订服务协议或合同确认的收入金额的5%计算限额。
例如，2011年4月，A公司委托王先生转让本公司持有的N公司30％的股权，投资成本2000万元，公司与王先生约定，转让价超过5000万元的部分，全部归王先生所有。10月，王先生为A公司找到一客户，双方签订的实际转让价格为8000万元。按照约定，A公司向王先生支付了佣金3000万元。则A公司应就取得股权转让所得6000万元，缴纳企业所得税。但允许A公司在所得税前列支的支付给王先生的佣金不得超过合同确认的收入金额的5％，即8000×5%＝400（万元），超过部分不得在税前扣除。
需要提醒纳税人注意的是，财税[2009]29号文件还规定，企业应与具有合法经营资格中介服务企业或个人签订代办协议或合同，并按国家有关规定支付手续费及佣金。除委托个人代理外，企业以现金等非转账方式支付的手续费及佣金不得在税前扣除。企业为发行权益性证券支付给有关证券承销机构的手续费及佣金不得在税前扣除。企业不得将手续费及佣金支出计入回扣、业务提成、返利、进场费等费用。企业已计入固定资产、无形资产等相关资产的手续费及佣金支出，应当通过折旧、摊销等方式分期扣除，不得在发生当期直接扣除。企业支付的手续费及佣金不得直接冲减服务协议或合同金额，并如实入账。企业应当如实向当地主管税务机关提供当年手续费及佣金计算分配表和其他相关资料，并依法取得合法真实凭证。
