如果研发机构未能在规定的期限内申报退税，根据《财政部 税务总局关于明确国有农用地出租等增值税政策的公告》（2020年第2号）的规定，待研发机构收齐凭证及信息后，仍可继续申报办理退税。
（六）税务机关如何审核办理退税
如果研发机构属于增值税一般纳税人，税务机关经审核符合规定的，应按规定办理退税。如果研发机构不是增值税一般纳税人，或者虽然是增值税一般纳税人、但使用增值税普通发票申报退税的，税务机关须确认发票真实、发票所列设备已申报纳税后，方能办理退税。
（七）已退税的国产设备转移或移作他用如何处理
