企业清算的所得税处理包括以下内容：1.全部资产均应按可变现价值或交易价格，确认资产转让所得或损失。2.确认债权清理、债务清偿的所得或损失。3.改变持续经营核算原则，对预提或待摊性质的费用进行处理。4.依法弥补亏损，确定清算所得。5.计算并缴纳清算所得税。6.确定可向股东分配的剩余财产、应付股息等。
例如，某房地产企业注销，注销之日的资产负债表记载：现有资产的账面价值3000万元（资产的计税基础相同）、资产的可变现净值4230万元，负债3700万元、最终清偿额3590万元，企业清算期内支付清算费用70万元，支付职工安置费、法定补偿金100万元，清算过程中发生的相关税费为20万元，以前年度可以弥补的亏损100万元。该企业为个人股东，股东投资成本500万元。企业所得税清算结果为，清算所得=4230－3000－70－100－20＋（3700－3590）－100=1050（万元），清算应缴纳企业所得税=1050×25%=262.5（万元），剩余资产=4230－3590－70－100－20-262.5=187.5（万元）。
企业注销清算清偿税费和所有债务后，剩余资产归股东所有。《企业所得税法实施条例》第十一条规定，投资方企业从被清算企业分得的剩余资产，其中相当于从被清算企业累计未分配利润和累计盈余公积中应当分得的部分，应当确认为股息所得。剩余资产减除上述股息所得后的余额，超过或者低于投资成本的部分，应当确认为投资资产转让所得或者损失。
注销资产的其他税务处理
企业注销时，由于注销后企业法人资格不存在，其相应资产应处置转让，根据现行税收政策规定，处置土地使用权和不动产的，应按资产的实际处置价（一般为资产的公允价值）缴纳营业税和土地增值税，同时开具发票给接收方（包括企业股东）。受让接收资产方，应按规定缴纳契税。但如果是债权人接收抵债资产的，可以不缴纳契税。《财政部、国家税务总局关于企业改制重组若干契税政策的通知》（财税[2008]175号）第六条规定，企业依照有关法律、法规的规定实施注销、破产后，债权人（包括注销、破产企业职工）承受注销、破产企业土地、房屋权属以抵偿债务的，免征契税。对非债权人承受注销、破产企业土地、房屋权属，凡按照《劳动法》等国家有关法律法规政策妥善安置原企业全部职工，其中与原企业30%以上职工签订服务年限不少于3年的劳动用工合同的，对其承受所购企业的土地、房屋权属，减半征收契税。与原企业全部职工签订服务年限不少于3年的劳动用工合同的，免征契税。
