第三，工程竣工结算管理方法的设置。工程结算以合同作为对象，因此合同管理成为工程结算基础工作。合同的编号应当同工程项目下可按照“工程项目代码——单位工程代码——往来单位代码——顷序号”编制。这样设计可以利用财务软件进行相关处理，也可将数据导出后，采用Excel等数据处理软件进行统计汇总，特别是在项目管理中没有“往来单位”时，可以利用Excel进行数据处理弥补财务软件的不足。同时，合同编号应在基建部门、财务部门、审计部门形成统一编号，便于信息沟通、数据核对。此外，在工程竣工结算时，应同往来单位进行账务核对，将核对日时往来账簿与往来单位对账单与合同一起存档，以防范工作风险。在填制会计凭证时，应当考虑到使用会计科目和项目核算时，有可能将一些信息遗漏，因而应在会计凭证中的摘要中将一些信息记录清晰。在工作实践中，如智能工程、空调安装工程可能涉及到几项单项工程、为了在事前方便工程结算和竣工决算，可以在合同中注明每项单项工程的工作量或成本、以及每个单项工程的往来款。
