北京市国税局在近几年的反避税工作中，以重点行业和典型案件为突破口，通过深入调查和认真分析，寻找调查对象的特点和规律，从而促进全市国税局系统反避税工作水平的整体提升。近年来，该局反避税工作成绩一直在全国名列前茅，2012年反避税调查补税金额全国排名第一，反避税对税收的贡献排名第二。
北京作为全国的政治、文化中心与国际交往中心，同时也是全国经济最发达的地区之一，跨境税源优势巨大，反避税形势严峻。据统计，截至2012年底，全市共有跨国公司地区总部127家，具有地区总部功能的外资企业228家，2010年有跨境关联交易申报的外商投资企业达14129户。
北京市国税局高度重视反避税工作，组建了专司反避税的专业化分局——北京市国税局第二直属税务分局。该分局局长邓远军介绍，在反避税实践中，北京市国税局从全市经济结构实际情况出发，把汽车制造业、药品制造业、软件业、电子商务等重点行业作为反避税监控的重点行业。通过开展行业调研，税务人员研究行业整体发展情况和营运模式以及产业链布局，找出行业价值链驱动因素和避税模式。在此基础上，该局加大对典型案件的反避税调查力度，采取以点带面的方式，促进反避税工作整体质量的提升。
2012年，北京市国税局配合国家税务总局经过四轮的长期谈判，成功谈签一例针对某软件行业大型跨国集团的双边预约定价安排。根据安排，该集团的中国公司一次性向中国补缴税款及利息共计8.4亿元，未来每年还将增加税收1亿多元，成为迄今为止我国反避税补税金额最大的案例，有力地维护了国家税收权益。不仅如此，该集团在全球行业中处于龙头地位，税务机关与其成功签订预约定价安排，在该行业具有很强的示范效应，对其他跨国公司也起到了较大的威慑作用，发挥了以查促管的积极作用。在该案例谈签过程中，北京市国税局还积极运用营销型无形资产与成本节约理念，创造性地提出将贝里比率作为中间利润率指标（贝里比率即边际毛利/营运开支，运用该比率能够量度公司的利润，判定公司收支是否平衡），实现了反避税工作理念和方法上的突破。
在2011年针对某跨国集团中国制药企业的调查中，北京市国税局的办案人员首先花费大量精力对制药行业整体情况和产业链中的赢利点进行详细了解，在此基础上认真分析企业功能风险和关联交易情况，顺利找出了企业避税疑点。在谈判中探索使用了国内上市制药公司的分部数据，根据所掌握的行业和企业相关信息，确定了企业的避税事实，企业最终于2012年底调整补税及利息1亿多元。该案件是北京市国税局第一例针对制药企业的调查，对今后加强制药行业的反避税管理与利润水平监控起到了积极作用。
另外，北京市国税局还认真研究无形资产的转让定价问题，成功开展了全国第一例电子商务、商标和市场型无形资产转让的反避税调查案件，为针对电子商务行业与无形资产转让的反避税工作积累了经验。
