可见，只要具有合同性质的购销往来凭证，要素虽不完全但明确了双方主要权利和义务的，就是印花税的应纳税凭证。
印花税征收范围的复杂化，纳税人建立《印花税应税凭证登记簿》比较困难，所以，查账征收与核定征收的确立要依据纳税人印花税凭据的保管、登记是否完整规范，以及是否在征管中出现违规等情况来进行判断，绝不允许在条件不明确的情况下任意确定其征管方式。在实际的征管中，常常出现地税部门忽视前提条件、未履行相关程序对企业进行证据收集，而直接确认纳税人的征管方式为核定征收，由此引起征纳双方的争议。
二、查账征收和核定征收模式履行的手续不同
查账征收和核定征收模式除在基本条件的认定上具有不同,在相关执行上也存在差异。对于核定征收模式，要求税务机关必须下达《印花税核定通知书》，内容包括核定的开始时间、纳税期限（按月或者是按季度申报缴纳）、核定的税目及核定的比例等，而查账不需要经过该程序。要注意的有两点：
一)是核定通知书原则上只注明核定的开始时间，并不包括终止时间。也就是说核定通知书一经送达，纳税人就需要按照核定通知书所指定的内容执行，除非政策变化，或者通知书内容发生变化，或者由核定转为查账征收等情形发生，否则并不需要税务机关每年对纳税人的印花税缴纳方式进行确定。
二)是核定征收通知书确定的税目不包括营业账簿和权利、许可证照两个税目。这两个税目的征收，核定征收和查账征收模式处理是一样的，没有差异，都是按照实际情况全额贴花。
三、查账征收和核定征收模式纳税期限和纳税地点存在差异
查账征收模式中一般在合同成立时贴花，其印花税税票的购买并不限于主管税务机关,凡有印花税税票销售的地方,纳税人均可自行购买、粘贴和注销。核定征收模式要求纳税人按月或者是按季度申报，并于期满之日起10日内向主管税务机关申报缴纳，这一点与查账模式下的汇总缴纳类似。但是由于一些合同需要贴花进行确认，核定征收模式允许在申报纳税时扣除已经贴花的税额部分，以防止重复纳税，这一点又与查账征收模式具有交叉。所以无论是纳税人还是税务机关，在核定征收模式中，都要特别留意是否存在合同已经贴花的情况，这对于准确判断纳税人是否少缴、是否涉嫌偷税等情况都有重要意义。
四、查账征收和核定征收计税依据认定存在差异
计税依据的认定上，查账和核定征收模式的差异更为明显，具体表现在：
