近年来，债券投资业务已成为金融企业拓宽资金运用渠道和改善资产结构的主要工具，债券投资收益也已成为金融企业收入的重要来源。由于我国目前的税收政策法规对于债券投资业务营业税的相关规定不尽明确，导致目前各地区之间，各金融企业之间对政策理解不一，执行差异较大。因此，在对债券投资业务正确进行财务核算的基础上，如何准确计算缴纳营业税已越来越引人关注。
金融企业债券投资的收益主要来自债券的利息收入和债券增值收入。利息收入是金融企业购买债券后，按照债券发行时确定利息率从债券发行人那里取得的收入。增值收入是资本增值收入，是指市场利率下降时，债券价格上升，金融企业将在较低价格购买的债券在市场上出售，买价与卖价之间的差额即为债券增值收入。金融企业持有某一债券的收益为其持有期间内分红派息收入加上出售时的增值收入。
对于利息收入营业税，要关注两项政策。一是《国家税务总局关于印发营业税税目注释（试行稿）的通知》（国税发[1993]149号）。该政策第三款规定，金融保险业本税目的征收范围包括“金融”和“保险”业务，“金融”业务是指经营货币资金融通活动的业务，包括贷款、融资租赁、金融商品转让、金融经纪业和其他金融业务。二是《国家税务总局关于印发金融保险业营业税申报管理办法的通知》（国税发[2002]9号，下称9号文件），该政策第三章第五条规定，贷款是指将资金有偿贷与他人使用（包括以贴现、押汇方式）的业务。以货币资金投资但收取固定利润或保底利润的行为，也属于这里所称的贷款业务。
根据以上文件，只要是金融企业购进的有价证券均属于9号文件规定的贷款业务，购进的债券取得的利息收入就应缴纳营业税。其中，根据《国库券条例》第十二条规定，国库券的利息收入享受免税待遇，即国债利息收入免征营业税。
对于债券买卖价差营业税，要关注的政策很多。
《营业税暂行条例》第五条规定，纳税人的营业额为纳税人提供应税劳务、转让无形资产或者销售不动产收取的全部价款和价外费用。但是，外汇、有价证券、期货等金融商品买卖业务，以卖出价减去买入价后的余额为营业额。
《营业税暂行条例实施细则》第十三条规定，条例第五条所称价外费用，包括收取的手续费、补贴、基金、集资费、返还利润、奖励费、违约金、滞纳金、延期付款利息、赔偿金、代收款项、代垫款项、罚息及其他各种性质的价外收费。
《财政部、国家税务总局关于营业税若干政策问题的通知》（财税[2003]16号，下称16号文件）第三条第八款规定，金融企业从事股票、债券买卖业务以股票、债券的卖出价减去买入价后的余额为营业额。买入价依照财务会计制度规定，以股票、债券的购入价减去股票、债券持有期间取得的股票、债券红利收入的余额确定。该条第九款规定，金融企业买卖金融商品，可在同一会计年度末，将不同纳税期出现的正差和负差按同一会计年度汇总的方式计算并缴纳营业税，如果汇总计算应缴的营业税税额小于本年已缴纳的营业税税额，可以向税务机关申请办理退税，但不得将一个会计年度内汇总后仍为负差的部分结转下一会计年度。
