研发费用的加计扣除，鼓励的是企业的研发行为。只有研发行为的存在，才可能形成新产品、新技术、新工艺。企业在税务上应该正确处理，以充分享受到税前加计扣除的税收优惠。
新企业所得税法第三十条第（一）项规定，企业开发新技术、新产品、新工艺发生的研究开发费用，可以在计算应纳税所得额时加计扣除。
企业所得税法实施条例第九十五条规定，企业所得税法第三十条第（一）项所称研究开发费用的加计扣除，是指企业为开发新技术、新产品、新工艺发生的研究开发费用，未形成无形资产计入当期损益的，在按照规定据实扣除的基础上，按照研究开发费用的50%加计扣除；形成无形资产的，按照无形资产成本的150%摊销。
例1：A公司自行研究开发一项技术，截至2008年6月30日，发生研发支出合计100万元，经测试该项研发活动完成了研究阶段，从2008年7月1日开始进入开发阶段。该阶段发生研发支出120万元，假定符合无形资产准则规定的开发支出资本化的条件。2008年12月31日，该项研发活动结束，最终开发出一项非专利技术。相关会计处理如下：
1、2008年6月30日前发生的研发支出：
借：研发支出—费用化支出 100
贷：银行存款等 100
2、2008年6月30日前，发生的研发支出全部属于研究阶段的支出：
借：管理费用 100
贷：研发支出—费用化支出 100
3、2008年下半年，发生开发支出并满足资本化确认条件：
借：研发支出—资本化支出 120
贷：银行存款等 120
4、2008年12月31日，该技术研发完成并形成无形资产：
借：无形资产—非专利技术 120
贷：研发支出—资本化支出 120
从上述企业研究开发费用的会计处理上看，企业在期末转账时并没有做加计扣除的会计处理，如例1第2笔分录，将不满足资本化条件的研究阶段的支出100万元，100%计入了当期损益。再如例1中的第4笔分录，将满足资本化条件的开发阶段的研发支出120万元，也100%转入了无形资产，未实行150%的加计扣除或加计摊销处理，这样使得企业对于自行开发无形资产发生的研究开发费用，就没有享受到税前加计扣除的税收优惠。
按企业所得税法的规定，研究开发费用的具体加计扣除的方式，应分两个阶段进行。
一、研究开发费用未形成无形资产
对于未形成无形资产的研究开发费用，应当计入当期损益，在按规定实行100%扣除的基础上，在计算应纳税所得额时，再按研究开发费用的50%加计扣除。
