专利权是一项有价值的无形资产，那么所有者是将专利权出售取得现金，还是把它作为出资，取得股权更合算呢?对专利权的处理一般来讲可以作如下选择：第一，出卖专利权以获取现实的收入；第二，个人独资兴办企业；第三，以专利权为出资方式与他人合伙经营或投资入股。
对于以上三种处理办法，在税收上缴纳金额和纳税时间是不同的。比如：有一位老年学者，经过多年的潜心研究，取得了一项发明专利权。专利权申请到时间不长，就有几家企业愿意以不低于100万元的价格购买该项专利权，另外一些企业则希望与他合作办实业。作为专利权的拥有者，他此时应该如何作出决策呢?
(一)直接销售取得现金的纳税
如果直接转让专利以取得现金，则可以得到100万元，但是同时应该缴纳有关税金。出售专利权收入主要应该缴纳营业税和个人所得税。按照营业税有关规定，转让专利权属于转让无形资产，应该缴纳营业税，税率为5％，该专利权的发明人应缴纳的营业税为：100×5％＝5(万元)
按照个人所得税法规的有关规定，转让专利使用权属于特许权使用费所得，应缴纳个人所得税。特许权使用费收入以个人每次取得的收入，定额或定率减除规定费用后的余额为应纳税所得额。因为该发明人一次收入已超过4000元，应减除收入20％的费用。所以应纳税为(95－95×20％)×20％＝15．2(万元)，缴纳个人所得税后他实际所得为79．8万元。
两税合计，该发明人缴纳了20．2万元的税，实际所得为79．8万元，这才是他实际可以支配的专利权转让的收入。
(二)直接投资的纳税
如果该发明人希望这项专利能给他今后带来长时间的收益的话，还是选择投资经营为好：通过投资建厂使自己所拥有的专利变为资本，然后通过销售产品取得收入。
此外，由于新建企业大多都可以享受一定的减免税优惠，而且专利权未转让，所以在其取得的收入中，不必单独为专利支付税收。在税收负担中，他要负担流转税、企业所得税、个人所得税，此时其收入与税收负担之比，必然优于单纯缴纳专利权收入的个人所得税，当然更主要的是他的资产通过经营过程实现了保值、增值，产生了长期的经济效益。当然，这样做是有条件的：一是要有其他资金的支持；二是要有经营才能。
(三)合伙经营的纳税
如果无力独立经营而选择与他人合伙经营，发明人出技术对方出资，建立有限公司形式或合伙制企业，那么双方只要事先约定好专利权占企业出资的比重，就可以根据各自占有企业资本的比例分配利润。他的专利权所折股本100万将在经营期内摊到产品的成本中，通过产品销售收回。除了企业应负担的税收外，他仅需要负担投资分红所负的税收额，而股份在转让之前则不需负担税收。比如，该发明人每年可从企业分回10万元的分红，只需要缴纳个人所得税，应纳金额是：10×20％＝2(万元)
