尽管对于从事异地建筑安装业务的个体单位或个人在代开具发票时，主管税务机关一般核定征收个人所得税，征收方式相对简单。但是还要注意征收管理中存在的问题。
1、A建筑施工企业既在A市施工，也在B市施工，所属员工个人所得税应该在A还是B市缴纳？按照国税发[1996]127号似乎两地均有管辖权，按照国税函[2001]505号规定，税不能重征。但企业没有选择的余地，只能被动接受纳税管理。难免存在两地在纳税管理中争抢税源的现象。
2、对于个体户或个人挂靠建筑企业施工，以建筑企业名义开具发票，工程所在地主管税务机关难以对于内部承包个体户或者个人实施有效管理。
3、营业税政策变化后，建筑企业将工程分包给个人，不能按照差额纳税。这样分包工程将会变相改为内部承包，内部施工不需要开具发票，建筑企业松散型管理，收取管理费，但一般都没有考虑内部承包应该收取的个人所得税。
