企业内部审计提出的处理意见和建议操作性强，能从根本上改善企业管理。内部审计提出处理意见和建议时，能从企业的实际出发，将损失减少到最小，还能从管理者的角度考虑如何改进管理、完善控制。同时，还可以对落实意见和建议的情况进行后续审计，从而促进企业建立起有效的内部控制系统，降低控制风险，防患于未然。
三、企业内部审计的局限性
企业利益与内部审计人员利益的一致性，降低了审计作用。当企业利益与个人利益一致时，内部审计人员为维护自身的利益，往往对不正当的企业行为采取默许的态度。如许多内部审计人员对企业通过变通给职工搞福利都不揭示、不处理，对企业加大成本费用、不遵守收入确认原则少计收入偷漏税款等做法予以默认等。
复杂的人际关系，影响了内部审计工作的深入开展。内部审计人员在开展工作时不可避免地会受到企业内部复杂人际关系的影响，有时会因内部关系而影响工作进程。特别是被审对象的职位、级别一般都比较高，出于各种考虑，内审人员往往在实施审计时睁一只眼闭一只眼，从而降低了审计质量。
内部审计的独立性有限，限制了审计工作的深入开展。内部审计和其他职能部门一样，一般都在管理层领导下工作，不可避免地会受领导意志所左右，加之内部政策的压力，内部审计在组织中的地位不明确等，使内部审计工作的开展受到了许多限制。
四、企业内部审计面临的问题
企业经营管理者对内部审计的认识不足。受长期计划经济的影响，部分企业领导人片面认为内部审计就是检查内部经济问题，会影响企业职工的团结和稳定，分散管理人员的精力，有的认为内部审计限制了自己的经营自主权，削弱了自己的权威，有的将内审机构形同虚设，使内审人员无职无权。
内审机构不健全，设置不合理，影响审计工作的正常开展。有的企业将审计机构和监察合并，有的在财会部门内设审计人员，有的干脆不设审计机构和人员。且审计部门与其他部门处于平行的地位，致使许多内部审计流于形式，缺乏自身应有的地位和威信，根本无法保证内部审计的独立性和权威性。
一些内部审计人员素质偏低，影响审计工作的质量和效果。主要表现在一是文化知识、理论水平和业务技能偏低，多数内审人员来自财会部门或从其他部门改行而来，专职人员少，兼职人员多，缺乏必要的审计专业知识和技巧，现代审计技术手段掌握不够，电算化内部审计几乎处于空白；二是个别审计人员受社会不良风气影响，丧失职业道德，利用手中的权利送人情、甚至以权谋私，降低了内审人员的威信和形象。
