财税[2009]69号文件强调，适用于《企业所得税法》第二十八条规定的小型微利企业待遇，应适用于具备建账核算自身应纳税所得额条件的企业，按照《企业所得税核定征收办法》（国税发[2008]30号）缴纳企业所得税的企业，在不具备准确核算应纳税所得额条件前，暂不适用小型微利企业适用税率。
《国家税务总局关于非居民企业不享受小型微利企业所得税优惠政策问题的通知》（国税函[2008]650号）指出：《企业所得税法》第二十八条规定的小型微利企业是指企业的全部生产经营活动产生的所得均负有我国企业所得税纳税义务的企业。非居民企业不适用小型微利企业税收优惠政策。
另外，上年度认定为小型微利企业的，其分支机构不就地预缴企业所得税，即分支机构在本年度各期的预缴申报中，作零申报处理。
