一、认真学习相关法律法规，领会其精神。中华人民共和国审计署令第3号《审计机关专项审计调查准则》第五条，明确规定了审计机关可以对下列事项进行专项审计调查：国家财经法律、法规、规章和政策的执行情况；行业经济活动情况；有关资金的筹集、分配和使用情况；本级政府交办、上级审计机关统一组织或者授权以及本级审计机关确定的其他事项。我们从以上事项中不难看出，专项审计调查所涉及的这些事项，大都有严格的法律法规所约束，这些审计调查事项本身都有一套系统的、较完善的法律法规体系，是一项政策性较强的工作。因此，审计调查首先要吃透相关法律法规精神，针对调查事项，认真学习研究与调查事项有关的法律法规和相关政策，吃透精神，把握好政策尺度。只有这样，才能做到有的放矢地开展专项审计调查。另外，审计人员在进行专项审计调查时，必须严格遵守国家法律、法规和政策，客观公正，实事求是，保守国家秘密和被审计单位的商业秘密。
二、制定周密实用的调查方案。对专项审计调查来说，制定好专项调查方案尤为重要。一是要认真细致地搞好审前调查。通过走访、座谈等形式，深入被调查单位，填写“审前调查表”，请被审计单位有关负责人介绍本系统、本单位财务收支的特点、管理体制和有关政策法规，详细了解被调查系统和单位的职责范围、资金来源和运用情况，在掌握基本情况的基础上，确定审计重点，为制定好专项调查方案打好基础。二是制定周密实用的调查方案。在做好审前调查的基础上，围绕调查目标、范围、内容、时间和人员分工等制定好调查方案，调查步骤和调查方法应详细制定，使调查方案真正做到切实可行。三是扎扎实实搞好审前培训。参审人员要提高对专项审计调查重要性的认识，熟悉所调查系统或单位调查事项资金的使用范围，了解有关政策、法规，吃透专项调查方案的要点，在全面掌握有关法律法规的基础上，进一步加深对专项调查方案的理解。四是积极争取被调查系统或单位的配合和支持，使其搞好自查自纠，是审计专项调查工作顺利开展的基础。
三、灵活运用各种审计方法。在确立专项调查事项资金源头的基础上，按资金流向顺藤摸瓜，一环扣一环开展专项审计调查。具体工作中应抓好以下几个结合：一是同级审与上审下、交 叉审相结合。各级审计机关特别是上级审计机关，在安排专项审计调查项目时，特别是大的行业或系统搞专项审计调查时，上级审计机关 在搞好同级专项审计调查同时，可上审下，亦可安排下级审计机关开展交叉审，这样更便于发现问题。二是重点调查与延伸调查相结合。针对许多行业系统摊子大、下属单位多、情况复杂的特点，应采取重点调查与延伸调查相结合的方法，在专项审计调查过程中，对一级单位全面调查，突出重点，对二、三级单位及其他调查对象，从调查事项资金线索入手进行延伸调查，可以收到事半功倍的效果。三是审计与专项审计调查相结合。针对目前国家审计机关审计人员少、审计工作量大的突出矛盾，在计划，安排时应考虑审计与专项审计调查相结合，这样既可以节省人力、物力，又可以通过审计全面掌握被调查单位的相关情况，提高专项调查的质量。四是上下联动，全局“一盘棋”。对于一些上下级联系紧密、资金往来密切的特殊行业，上级审计机关在计划安排上，要统一安排调查一个行业或系统，实施调查过程中，充分利用现有的审计资源，采取上下联动、全局“一盘棋”方法，将行业专项审计调查看作一个项目，相互提供线索，提高调查的效率。
