Ferdinand和Judy （1998）将盈余管理与审计意见联系起来考察，首先检验了应计利润分离法的各种模型计量盈余管理的效果，然后将其与审计意见类型联系起来。他们发现企业盈余管理程度越高越有可能被出示保留意见。其潜在逻辑是盈余管理扭曲了会计信息，增加了企业的投资风险。
章永奎，刘峰（2002）选取了满足扩展的Jones模型的数据，将1998年年报被出具非标准无保留意见的128家上市公司作为测试样本，同时选取1998年年报被出具标准无保留意见的128家上市公司作为控制样本。以盈余管理为桥梁，通过检验盈余管理与审计意见之间的相关性来检验注册会计师的执业质量，其实证结果显示：注册会计师能够在一定程度上审计出盈余管理，不同类型的会计师事务所审计质量存在差别。
何红渠，张志红（2003）选取沪市制造行业2000年和2001年两年所有被出具非标准无保留审计意见的上市公司作为样本，并随机抽取相同数目、相同行业、相同期间被出具标准无保留审计意见的上市公司作为配对样本，其研究结果表明：审计意见具有一定的信息含量，能在一定程度上揭示出上市公司的盈余管理现象，并找到了2001年独立审计质量得到提高的证据。
徐浩萍（2004）从盈余管理的角度考察了中国注册会计师独立审计的质量，她对修正的Jones模型进行了再修正，选取了1997年及以前在上海证券交易所公开发行股票的公司1998-2001年的年报数据，研究发现，中国的注册会计师能够在一定程度上鉴别会计盈余管理，这种鉴别的能力与盈余管理的手段有关。
李维安、王新汉、王威（2005）选取1998-2001年A股上市公司进行实证研究，选择非经营性收益占总利润的比例作为盈余管理指标，证明盈余管理越高的公司，收到非标意见的可能性越大。并且还进一步对非标意见进行了归类分析，发现公司盈余管理行为仅仅会增加收到“带强调事项段的无保留意见”的可能性，而对其他类型非标意见的出示则无显著影响。
李越冬，倪婕（2008）选取沪市制造行业2004-2005年的财务数据，通过截面修正的Jones模型和多元回归方法，对审计意见识别盈余管理水平的能力进行了实证研究，研究结果表明，审计意见具有一定的信息含量，能在一定程度上揭示出上市公司的盈余管理现象。
综上所述，一定程度上，盈余管理程度越高的公司，被出具非标准无保留审计意见的可能性越大。当然，受制于研究样本的选择、盈余管理计量模型的选择和财务数据来源的可靠性等因素的影响，研究上市公司盈余管理对审计意见的影响并不总能得到一致的结论和观点，只有不断完善研究条件、丰富研究假设和拓展研究方法，才能使今后的研究得出更加精细和准确的结论。
